ההבדל בין AFLP ו- RFLP | AFLP vs RFLP

הפרעות קשביות - AFLP לעומת RFLP

למחקרי DNA חשיבות עצומה בהבנה וקביעת קשרים פילוגנטיים, אבחון מחלות גנטיות ומיפוי הגנום של האורגניזם. מספר טכניקות הקשורות לניתוח DNA משמשות גם לזיהוי גן מסוים או רצף דנ"א בבריכה של דנ"א לא ידוע. הם ידועים כמו סמנים מולקולריים. טווח פיזור מוגבר פולימורפיזם (AFLP) ו- פיזור הגבלת אורך פולימורפיזם (RFLP) הם שני סמנים מולקולריים (שיטות) שפותחו בביולוגיה מולקולרית כדי לזהות וריאציה גנטית בין אורגניזמים. שתי השיטות הן חשובות באותה מידה ויש להן יתרונות וחסרונות. ההבדל העיקרי בין AFLP ו RFLP הוא כי AFLP כרוך הגברה PCR סלקטיבית של ה- DNA מתעכל בעוד RFLP אינו כרוך הגברה PCR סלקטיבית של שברי ה- DNA.

-> ->

תוכן

1. סקירה והפרש מפתח

2. מה זה AFLP

3. מה זה RFLP

4. השוואה בין-צדדית - AFLP vs RFLP

5. סיכום

מהו AFLP?

AFLP (מוגבר קטע אורך פולימורפיזם) הוא כלי חשוב בביולוגיה מולקולרית והוא משמש בהרחבה ניתוח גנטי וריאציה. AFLP מבוסס על הגברה ספציפית PCR של DNA גנומי מקוטע וזיהוי של פולימורפיזם על ידי autoradiographs באמצעות ג'ל אלקטרופורזה. AFLP תורמת רבות לזיהוי הבדלים גנטיים בזנים או במינים קרובים של ממלכות שונות, כולל צמחים, בעלי חיים, חיידקים ופטריות. AFLP יכול להתבצע עם כמויות קטנות של דגימות DNA לא ידוע. זה אינו דורש ידע רצף מראש ועיצוב של בדיקות.

->

צעדים של AFLP

1. בידוד של דנ"א
2. עיכול של ה- DNA עם endonucleases הגבלה
3. קשירת שברי DNA מוגבל עם מתאמים
4. הגברה סלקטיבית של שברי עם הגבלה ספציפית אתרי אינטרנט
5. הפרדת מוצרי ה- PCR על ידי ג'ל אלקטרופורזה
6. ויזואליזציה של מטריצת ג'ל על ידי אוטורדיוגרף

AFLP היא שיטה רגישה יותר לשחזור אשר ניתן להשתמש ב פרופיל DNA של כמה מסים כולל פטריות, חיידקים, צמחים בעל חיים ללא ידע מוקדם של רצפי דנ"א. זה עוזר בזיהוי הבדלים קלים בין אנשים באוכלוסיות בשל אופי רגיש מאוד שלה. AFLP חשוב גם במיפוי הגנום, מחקרים משפטיים, בדיקות הוריות, גנוטיפינג וכו '

תמונה 01: AFLP

מהו RFLP?

גבול הגבלת אורך פולימורפיזמים (RFLPs) היא טכניקה המשמשת לזיהוי וריאציות גנטיות רצפי DNA הומולוגיים.זוהי השיטה הראשונה שפותחה עבור פרופיל DNA. אורגניזמים יש טביעות אצבע ייחודיות DNA או פרופילים DNA. RFLP משמש ככלי חשוב לנתח את וריאציה בין פרופילי DNA של intraspecific או קרובים הקשורים אורגניזמים מאז רצפים הומולוגיים יש אתרי הגבלה שונים (מיקומים), כי הם ייחודיים לאורגניזם מסוים. כאשר הדנ"א הומוגסי מתעכלים עם endonucleases הגבלה ספציפיים, זה יגרום פרופילים שונים DNA ייחודי לכל אדם. לכן, העיקרון של שיטה זו הוא זיהוי של וריאציה גנטית בין אורגניזמים על ידי הגבלת DNA הולוגולוגי עם אנזימים הגבלה ספציפיים וניתוח של אורך פולימורפיזם אורך באמצעות ג'ל אלקטרופורזה ו סופג. דפוסי סופג הם ייחודיים לכל אורגניזם ולאפיין את גנוטיפים ספציפיים.

צעדים של RFLP

1. בידוד של כמות מספקת של DNA מ דגימות
2. פיצול של דגימות DNA עם הגבלת endonucleases ספציפיים לתוך רצף קצר
3. ההפרדה של שברי וכתוצאה מכך אורכים שונים על ידי אלקטרופורזה ג'ל agarose.
4. העברת פרופיל ג'ל לתוך קרום על ידי דרום סופג

5. הכלאה של הממברנה עם בדיקות שכותרתו וניתוח של פולימורפיזם אורך קטע בכל פרופיל

RFLP היא טכניקה חשובה מאוד בזיהוי מורשת המחלה ומציאת הסיכון להתפתחות המחלה בקרב בני המשפחה. RFLP משמש גם לעתים קרובות מיפוי הגנום, זיהוי עבריינים בזיהוי פלילי, בדיקות אבהות, וכו 'RFLP יש מספר מגבלות גם כן. RFLP דורש ידע מוקדם של נתונים ברצף כדי בדיקות עיצוב עבור הכלאה. זה גם דורש בידוד של כמות מספקת של DNA מן המדגם לנתח, אשר קשה במחקרים משפטיים.

איור 01: מיפוי RRFLP

מה ההבדל בין AFLP לבין RFLP?

- diff מאמר ביניים לפני טבלה ->

ALFP לעומת RFLP
AFLP כרוך הגברה PCR סלקטיבית של ה- DNA מתעכל.	RFLP אינו כרוך PCR אלא אם כן הוא PCR-RFLP.
ידע רצף
ידע רצף קודם אינו נדרש.	ידע רצף קודם נדרש בדיקות RFLP תוכנן.
אמינות
זה אמין יותר.	זה פחות אמין לעומת AFLP.
יעילות בזיהוי פולימורפיזם
זה יש יעילות גבוהה יותר באיתור פולימורפיזם מאשר RFLP.	זה פחות יעיל בהשוואה AFLP.
עלות
זה קצת יקר לעומת RFLP.	זה פחות יקר לעומת AFLP.
יישומים
AFLPs הוחלו על מיפוי גנום, טביעת אצבע של דנ"א, מחקרים על גיוון גנטי, בדיקות אבהות וזיהוי פלילי	ניתוח RFLP הוא כלי חשוב במיפוי הגנום, לוקליזציה של גנים להפרעות גנטיות, קביעת הסיכון מחלה, בדיקות אבהות.

סיכום - AFLP לעומת RFLP

AFLP ו- RFLP הן שתי טכניקות המשמשות כסמנים גנטיים להערכת גיוון והערכה של היחסים הגנטיים בביולוגיה מולקולרית.AFLP משמש שיטה יעילה ורגישה לאיתור של פולימורפיזם גנטי בין אורגניזמים מאשר RFLP. עם זאת, למרות ששיטות אלה יש יעילות שונות באיתור וריאציות גנטיות, הם עדיין משמשים טביעת אצבע DNA דלקת אבחון.

הפניה:

'1. גרסיה, אנטוניו א. פ., לוצ'יאנה ל. בנצ'ימול, אנטוניה מ 'ברבוסה, איסאיאס א. ג'רלדי, סוזה ג'וניו קלאודיו ל' ואנט פ 'דה סוזה. "השוואה של RAPD, RFLP, AFLP ו SSR סמנים עבור מחקרים שונים בקווים תירס טרופי תירס. "גנטיקה וביולוגיה מולקולרית. Sociedade Brasileira דה Genética, 2004. אינטרנט. 19 מרץ, 2017

2. "הגבלת שברי אורך פולימורפיזם (RFLP). "המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי. U. S. הספרייה הלאומית לרפואה, n. ד. אינטרנט. 19 מרץ 2017

3. מסיגה ד 'ק' וטרנר מ '(2004). "מוגבר (הגבלה) אורך קטע פולימורפיזם (AFLP) ניתוח". שיטות מול ביול: 270: 173-86. NCBI. אינטרנט. 19 מרץ, 2017

Image באדיבות:

1. "ALFP" על ידי Barbarossa ב ויקיפדיה ההולנדית - הועבר מ nl. ויקיפדיה למוזיקה. (Public Domain) באמצעות ויקיפדיה

2. "מיפוי RFLP" על ידי Retama - עבודה עצמאית (GFDL) באמצעות Commons Wikimedia