ההבדל בין תרגום ניק ואת פריימר הרחבה | ניק תרגום לעומת פריימר הרחבה

Anonim

ההבדל העיקרי - ניק תרגום לעומת פריימר הרחבה

ניק תרגום פריימר הרחבה הן שתי טכניקות חשוב בביולוגיה מולקולרית. ההבדל העיקרי בין התרגום nick ו פריימר הרחבה היא כי תהליך התרגום nick מייצרת בדיקות שכותרתו עבור טכניקות הכלאה אחרים תוך שיטת הרחבה פריימר מזהה רצף מסוים RNA מתערובת חושף מידע על הביטוי של mRNA. שתי הטכניקות יש חשיבות רבה והם מבוצעים באופן שגרתי במעבדות מחקר מולקולרי.

-> ->

תוכן

1. סקירה והפרש מפתח

2. מה זה ניק תרגום

3. מהו הרחבה פריימר

4. השוואה בין-צדדית - ניק תרגם לעומת פריימר הרחבה

5. סיכום

מה זה ניק תרגום?

תרגום ניק הוא טכניקה חשובה המשמשת להכנת בדיקות שכותרתו עבור טכניקות ביולוגיות שונות כגון סתימת, הכלאה in situ, פלואורסצנטי in situ הכלאה וכו 'זה in vitro שיטת תיוג ה- DNA. בדיקות DNA משמשים לזהות רצפי DNA ספציפיים או RNA. בעזרת בדיקה שכותרתו, שברי ספציפיים ניתן לסמן או דמיינו מתערובת מורכבת של חומצה גרעין. לכן, בדיקות שכותרתו מוכנים באמצעות טכניקות שונות לשמש טכניקות שונות. תרגום ניק הוא אחד כזה שיטה אשר מייצרת בדיקות שכותרתו בעזרת DNase 1 ו DNA פולימראז 1 אנזימים. -> ->

תהליך התרגום nick מתחיל עם פעילות האנזים DNase 1. DNase 1 מציג nicks בעמוד השדרה פוספט של DNA כפול תקועים על ידי חיזוק קשרי phosphodiester בין נוקליאוטידים. לאחר ניק נוצר חינם 3 'קבוצה OH של נוקליאוטידים יהיה הניב ו DNA פולימראז 1 אנזים יפעל על זה. 5 'עד 3' פעילות exonuclease של פולימראז DNA 1 מסיר נוקליאוטידים מן ניק לכיוון לכיוון 3 'של גדיל ה- DNA. במקביל, פעילות polymerase של אנזים DNA פולימראז 1 עובד ומוסיף נוקלאוטידים להחליף את הנוקליאוטידים שהוסרו. אם נוקליאוטידים מתויגים, החלפה תתרחש על ידי נוקליאוטידים שכותרתו והוא יסמן את ה- DNA לזיהוי. זה מסונתז DNA החדש מסומן יכול לשמש בדיקות בדיקות שונות הכלאה ביולוגיה מולקולרית.

איור 01: תהליך תרגום ניק

מהו הרחבה פריימר?

פריימר הרחבה היא טכניקה המשמשת כדי למצוא רצף RNA ספציפי מתערובת RNA ולאתר את הקצה 5 'של תמליל mRNA. הוא משמש גם כדי ללמוד את המבנה של RNA וביטוי. שיטת הארכת פריימר מתבצעת עם primers שכותרתו או עם נוקליאוטידים שכותרתו. אם primers שכותרתו משמשים, זה כולל את הצורך של תיוג נוקליאוטידים המשמשים לסינתזה של cDNA. ישנן מספר שלבים בטכניקה זו. זה מתחיל עם החילוץ של RNA מן המדגם. ואז מתויג oligonucleotide תחל הוא הוסיף לתערובת יחד עם החומרים הדרושים כדי לסנתז cDNA של רצף מסוים RNA. פריימר anneals עם רצף משלים מן התערובת. באמצעות רצף annealed תחל כתבנית, האנזים transcriptase הפוך מסנתז את ה- DNA המשלימה (cDNA) של רצף RNA. פריימר חישול שעתוק לאחור להתרחש רק כאשר רצף RNA ספציפי קיים במדגם. לבסוף, כאשר denaturing ג'ל אלקטרופורזה מבוצעת, את גודל רצף RNA ניתן לקבוע. זה גם קל למצוא את בסיס +1 של רצף mRNA (שעתוק האתר ייזום) על ידי שיטת הרחבה פריימר. כמות mRNA נוכח המדגם הוא ניתן לכמת בשיטה זו אם פריימר עודף משמש.

איור 02: הרחבה ראשונית

מה ההבדל בין תרגום ניק לבין פריימר סיומת?

- diff מאמר ביניים לפני טבלה ->

ניק תרגום לעומת פריימר הרחבה

ניק תרגום הוא תהליך אשר יוצר בדיקות DNA שכותרתו עבור תגובות הכלאה שונים.

פריימר הרחבה היא טכניקה המשמשת כדי למצוא רנ"א ספציפי או ללמוד ביטוי גנים. אנזימים משמשים
DNase 1 ו DNA אנזימים פולימראז משמשים.
אנזים transcriptase הפוך משמש. חשיבות
תרגום ניק מאפשר סימון של רצף DNA ספציפי.
הרחבה פריימר מאפשר זיהוי של גודל רצף מסוים mRNA ואת כמות נוכח במדגם. סיכום - ניק תרגום לעומת פריימר הרחבה

ניק תרגום הוא שיטה המשמשת לסנתז בדיקות שכותרתו בהתבסס על הפעילות של DNase 1 ו

E coli DNA פולימראז 1 אנזימים. זוהי שיטה במבחנה המשמשת במעבדות לפני טכניקות הכלאה שונות. במהלך התרגום nick, 5'3 'פעילות exonuclease של פולימראז DNA 1 מסיר נוקליאוטידים לפני פעילות ניק ו polymerase של פולימראז DNA 1 מחליף את הנוקלאוטידים הוסר עם נוקליאוטידים שכותרתו מאחורי ניק. פריימר הרחבה היא שיטה אשר משמש כדי לזהות תמליל רנ"א מסוים מתערובת לכמת את הגודל ואת כמות הריבית RNA. זה ההבדל בין התרגום nick ו פריימר הרחבה. הפניות

1. ריד, אלכס. "ניק תרגום. "ספרינגר. נ., n. ד. אינטרנט. 18 אפריל 2017

2. "הרחבת פריימר. אבחון לאומי. נ., n. ד. אינטרנט. 19 אפריל 2017

3. קואו, מ'ט', וו' פלאנקט."ניק תרגום של כרומוזומי metaphase: תיוג במבחנה של אזורים nuclease-hyperensensitive בכרומוזומים. "ההליכים של האקדמיה הלאומית למדעים של ארצות הברית של אמריקה. הספרייה הלאומית לרפואה, פברואר 1985. אינטרנט. 19 אפריל 2017

4. ריימונד ואחרים. "פשוט, כמותי פריימר הרחבה assay PCR לניטור ישיר של microRNAs ו - RNAs להפריע קצר. "רנ"א. זכויות יוצרים 2005 על ידי החברה RNA, נובמבר 2005. אינטרנט. 19 אפריל 2017

Image באדיבות:

1. "פריימר הרחבה Assay" על ידי Jjnmmnjj - עבודה לבד (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia