ההבדל בין עץ פילוגנטי מושקע ובלתי מובלט | שורש לעומת עץ Unrooted Phylogenetic

Anonim

ההבדל העיקרי - שורש לעומת עץ Unrooted Phylogenetic

פילוגני הוא שדה חשוב אשר בוחנת את החיים על פני כדור הארץ דרך הזמן. הוא חושף את הקשר בין אורגניזמים עם אבותיהם וצאצאיהם. היחסים בין האורגניזמים מיוצגים באופן דיגרמטי על ידי ייצוגים שונים דמויי עץ כגון דנדוגרמה, קלדוגרמה, פנוגרמה, פילוגרמה וכו '. עץ פילוגנטי הוא עץ מתרשים דמוי תרשים, המסביר את היחסים הפילוגנטיים בין אורגניזמים עם כמות המרחק האבולוציוני. ישנם שני סוגים עיקריים של עצים phylogenetic הידועה בשם מושרשת unrooted. ההבדל העיקרי בין העץ הפיליוגנטי המושרש והבלתי משורטט הוא ש עץ מושרש מראה את האב הקדמון הבסיסי ביותר של העץ בעוד לא עץ הפיליוגנטי אינו מראה שורש אבות.

-> ->

תוכן

1. סקירה והפרש מפתח

2. מהו עץ פילוגנטי מושרש

3. מהו עץ Phylogenetic Unrooted

4. השוואה בין-צדדית - שורש לעומת אילן פילוגנטי לא מסודר

5. סיכום

מהו עץ פילוגנטי מושרש?

עץ פילוגנטי מושרש משמש תרשים שימושי המציג את ההיסטוריה האבולוציונית. יש לו צומת הבסיס אשר נקרא השורש, המייצג את האב הקדמון המשותף של כל קבוצות העץ. שורש העץ נחשב לנקודה העתיקה ביותר בעץ המייצג את האב הקדמון האחרון של כל הקבוצות הכלולות בעץ. לפיכך, עץ מושרש מראה את כיוון הזמן האבולוציוני. מתוך מינים בודדים של עץ מושרש, ניתן למצוא את המוצא המשותף או את אב קדמון המינים על ידי חזרה אל הצומת הבסיסית. מאחר שהעץ המושרש מתאר את כיוון הזמן האבולוציוני, קל למצוא את הקבוצות המבוגרות או החדשות יותר. עץ מושרש ניתן להשתמש כדי ללמוד את כל הקבוצות של אורגניזמים. השתרשות מדויקת של עץ פילוגנטי היא גורם חשוב ומכריע שכן השתרשות לא מדויקת עלולה לגרום לפרשנויות שגויות של שינויים גנטיים בין אורגניזמים לבין כיוונם של האבולוציה.

-> ->

איור 01: עץ פילוגנטי שורש

מהו עץ פילוגנטי שלא פורסם?

עץ phylogenetic unrooted הוא דיאגרמה פילוגנטית אשר חסר אב קדמון משותף או צומת הבסיס. סוג זה של עץ אינו מציין את מקור האבולוציה של קבוצות העניין.הוא מתאר רק את הקשר בין אורגניזמים ללא קשר לכיוון של קו הזמן האבולוציוני. לכן, קשה ללמוד את היחסים האבולוציוניים של הקבוצות ביחס לזמן באמצעות עץ לא מעובד.

ישנן שתי דרכים עיקריות לשורש עץ phylogenetic unrooted. הם

  • מציאת קבוצה - זה דורש ידע מוקדם על היחסים בין המינים. לאחר מכן, ניתן למצוא את המצע הנמצא מחוץ לקבוצה, כקבוצה חיצונית, כדי לצייר עץ פילוגנטי מושרש
  • מציאת נקודת האמצע או המרחק - נקודת האמצע של שני המישורים המרוחקים ביותר בעץ ניתנת להנחה כשורש לעץ הפילוגנטי.

איור 02: עץ Phylogenetic Unrooted

מה ההבדל בין עץ Phylogenetic שורש ו Unrooted?

- diff מאמר בינוני לפני טבלה ->

שורשים לעומת עץ Phillogenetic Unrooted

עץ פילוגנטי מושרשת היא תרשים המציג את האב הקדמון האחרון של הקבוצות. עץ פילוגנטי לא מסומן מראה את היחסים בין האורגניזמים מבלי להראות את האב הקדמון המשותף.
צומת
יש לו צומת (שורש). אין לו צומת.
כיוון האבולוציה
יש לו כיוון כדי לציין את הזמן האבולוציוני. זה לא מפרט מערכת יחסים אבולוציונית.
היחס כלפי אחרים
העץ מאפשר לקבוע את היחסים בין צאצאיהם של צאצאיהם. העץ אינו מאפשר לדבר על יחסי אב קדמון.

תקציר - שורש לעומת אילן פילוגנטי לא מבוקר

עץ פילוגנטי מייצג את המסלולים האבולוציוניים והקשרים בין האורגניזמים באמצעות דיאגרמות דמויי עץ מסועפות. Phylogenetic tress יכול להיות מושרשת או unrooted. עץ מושרש יש צומת בבסיס, המייצג את האב הקדמון המחבר את כל קבוצות העניין. עץ לא מוצג מראה את היחסים בין אורגניזמים. עם זאת, הוא אינו מתאר את אב קדמון משותף כי כל הקבוצות לשתף. זהו ההבדל בין עץ phylogenetic מושרשת unrooted.

הפניות:

1. "עץ" עובדות: שורשים לעומת עצים לא מסודרים. "המרכז הלאומי למידע ביוטכנולוגי. U. S. הספרייה הלאומית לרפואה, n. ד. אינטרנט. 04 אפריל 2017

2. גרהם, שון וו, ריצ'רד ג 'אולמסטד, וספנסר ג'. בארט. "השתרשות עצים פילוגנטיים עם Outgroups מרוחקים: מקרה לדוגמה של Monocots Commelinoid. "ביולוגיה מולקולרית ואבולוציה. אוקספורד University Press, 01 אוקטובר 2002. 04 אפריל 2017