ההבדל בין קשירת הקצה הדביקה והקוצפת | Blunt לעומת קשירת קצה דביק
ההבדל העיקרי - Blunt לעומת קשירת קצה דביק
endonucleases הגבלה הם אנזימים ספציפיים אשר לחתוך DNA כפול תקועים (dsDNA). הם ידועים גם מספריים מולקולריים בביולוגיה מולקולרית. אנזימי הגבלה מסוגלים לזהות רצפים קצרים ספציפיים של dsDNA הידועים כאתרי הכרה וקושרים את פוספודיסטר ואת קשרי המימן כדי לפתוח קווצות כפולות. כתוצאה מחשוף על ידי אנזימים אלה, שברי דנ"א מיוצרים עם סוגים שונים של קצוות כגון קצוות דביקים קצוות קהה. DNA ligase הוא אנזים המשמש ביולוגיה מולקולרית להצטרף שני גדילים סמוכים של DNA על ידי יצירת קשרים חדשים. הצעד ידוע בשם קשירת ועל פי סוג של ה- DNA סוף ligated, הם יכולים להיקרא קשירה סוף קהה קשירת סוף דביק. ההבדל העיקרי בין קשירת קצה בוטה ו דביק הוא כי קשירת סוף קהה מתרחשת בין שברי דנ"א אשר מכילים שני הקצוות קהה בעוד קשירת קשירת קצה דביק בין 5 'ו 3' overhangs. לעומת קשירת סוף קהה, קשירת קשירה דביק יעיל ויעיל יותר.
-> ->תוכן
1. סקירה והפרש מפתח
2. מה זה קשירת הקצה
3. מהו קשירת קצה דביק
4. השוואה זו לצד זו - Blunt vs קשירת קצה דביק
5. סיכום
מהו קשירת קצה קהה?
כמה endonucleases הגבלת יכול לחתוך את ה- DNA בבסיסים מנוגדים לייצר שברי DNA סוף קהה. אנזימים אלה ידועים כמו חותכי קצה קהה; הם מתחברים ישר לאמצע אתר ההגבלה מבלי להותיר בסיסים תלויים יחידים. Blunt מסתיים ידועים גם שאינם overhanging מסתיים מאז אין להם 3 'ו 5' בסיסים התלויים על הקצוות. שתי החוטים מסתיימים מזוגות בסיס בקצוות קהים. אנכימים חיתוך בוטה סוף סוף הם EcoRV HaeIII, AluI ו SmaI.
קשירת קשירה בוטה מעורב בין שני קצוות קהה. זה לא חיבור של בסיסים בולטים. קשירת זה הוא פחות יעיל מאשר קשירת סוף דביק. עם זאת, במקרים מסוימים, קשירת קצה קהה הופך להיות יתרון יותר קשירת קצה דביק, במיוחד כאשר ligating מוצרים PCR. מוצרי PCR מיוצרים תמיד עם קצוות קהה. קשירת הקצה קהה אינו דורש משלימים משלימים את ה- DNA עבור קשירת.
איור 01: הפקת סיום קהה על ידי אנזים RV אקו
מהו קשירת קצה דביק?
כמה endonucleases הגבלה מסוגלים לחתוך dsDNA, ומשאיר חתיכת התלוי של DNA יחיד תקועים בסוף. מסים אלה ידועים כמו מסתיים דביק או התלוי. קשירת קצה דביק מתרחשת בין שני שברי דנ"א אשר מכילים התאמות התואמות כי הקצוות דביק הם בבעלות עם בסיסים unaired ודורשים בסיסים משלימים כדי ליצור קשרים. לפיכך, יש צורך להשתמש באותו אנזים הגבלה עבור שני מקורות של DNA כדי לייצר את התאמות ligating שברי.
קשירת קצה דביק הוא יעיל יותר, והוא לעתים קרובות רצוי מאוד שיבוט תהליכים. ישנם מספר אנזימים הגבלה אשר מייצרים קצוות דביקים. הם Ecori, BamHI, HindIII וכו '
איור 02: סיום סוף דביק על ידי אנזים RI אנזים
מה ההבדל בין Blunt ו קשירת סוף דביק?
- דיפר סעיף ביניים לפני טבלה ->
Blunt לעומת קשירת קצה דביק |
|
קשירת קשירה בלאנט מתרחשת בין שני שברי דנ"א סוף קהה. | קשירת קצה דביק מתרחשת בין שני קטעי DNA תואמים עם קצוות דביקים. |
אנזימים | |
חותכי קצה קהים מייצרים קצוות קהים. | חותכי קצה דביקים מייצרים קצוות דביקים או מלוכדים. |
הדרישה של הקצוות התואמים | |
היא אינה דורשת שברים תואמים או בסיסים משלימים. | זה דורש בסיסים משלימים על הקצוות כדי ליצור זוגות בסיס. |
יעילות | |
זה פחות יעיל מאשר קשירת קצה דביק | זה יעיל יותר מאשר קשירת קשוח קהה. |
סיכום - Blunt לעומת קשירת קצה דביק
endonucleases הגבלה מסוגלים לדבוק dsDNA לייצר שברי דנ"א עם קצוות שונים. הם מזהים רצפים ספציפיים ומגבילים את הדנ"א ליצירת מסגרות דביקות וקשות. מסתיים דביק יש בסיסים unaired בסוף השברים. Blunt מסתיים נוצרים עקב מחשוף ישר ויש להם זוגות בסיסיים. קשירת קצה דביק דורש שני חתיכות DNA משלימה יחיד יחיד. קשירת קצה קהה מתרחשת בין שני שברי קצה קהה. זהו ההבדל בין קשירת בוטה דביק.
הפניות:
1. רוברטס, ריצ'רד ג '. "כיצד אנזימי הגבלה הפכו לסוסי העבודה של הביולוגיה המולקולרית. "ההליכים של האקדמיה הלאומית למדעים. לאומי למדעי החברה, נ. ד. אינטרנט. 12 אפריל 2017
2. עדנאן, אמנה. שימושים של אנזימים הגבלה בביוטכנולוגיה. נ., n. ד. אינטרנט. 12 אפריל 2017
Image באדיבות:
1. "אתר הגבלת EcoRV. rsh "מאת רמין הראטי - נוצר עם אינקסקייפ (Public Domain) via Commons Wikimedia
2. "אנזים הגבלה אקו RI" על ידי Tinastella - עבודה עצמאית (Public Domain) via Commons Wikimedia