תרכובות אורגניות ואנאורגניות הם שני חומר שונה לחלוטין. מוקדם יותר היה לחשוב שתרכובות כימיות באורגניזמים חיים שונות במהותן מאלו שבדברים שאינם חיים, שכן האמינו שלכימיקלים המיוצרים על ידי יצורים חיים יש חיוניות או נשימה. עם זאת, בשנת 1823, המדען הגרמני פרידריך וולר הוכיח כי זה לא נכון כפי שהוא יכול להוכיח קווי דמיון בין תרכובות של דברים שאינם חיים אורגניזמים חיים. זה סלל את הדרך להבחנה בין תרכובות אורגניות אורגניים אשר אמר כי כל תרכובת שהתגלו אורגניזמים חיים מכיל את האלמנט פחמן. ווהלר הראה כי עקרונות הכימיה מיושמים היטב לתרכובות הנמצאות באורגניזמים חיים ובדברים שאינם חיים. עם זאת, ישנם הבדלים משמעותיים בין תרכובות אורגניות ו אנאורגניות המנויות להלן.
הפרעות בין תרכובות אורגניות ואנאורגניות
• מספר התרכובות האורגניות גדול בהרבה מתרכובות אנאורגניות, וזאת בשל היכולת המיוחדת של אטום פחמן להצטרף לאטומי פחמן אחרים בטבעות, שרשראות וצורות גיאומטריות אחרות. ישנם יותר מ -10 מיליון תרכובות אורגניות ידוע לנו היום.
• תרכובות אורגניות יש הרבה יותר נמוך להיתוך נקודות רותחים מאשר תרכובות אורגניות, אם כי יש יוצאים מן הכלל.
באופן כללי, תרכובות אורגניות פחות מסיסות במים מאשר תרכובות אורגניות.
תרכובות אורגניות הן דלקתיות יותר, אך הן מוליכות עניות יותר של חום וחשמל מאשר תרכובות אורגניות.
תרכובות אורגניות מגיבות בקצב איטי יותר ומייצרות סדרה הרבה יותר מורכבת של מוצרים מאשר תרכובות אורגניות.
תרכובות אורגניות נגזרות מפעילויות של אורגניזמים חיים ואילו תרכובות אנאורגניות נוצרות עקב תהליכים טבעיים או מבוצעות במעבדה. אולם וולר מצא חריגים.
• בשל קוולנטיות של פחמן, תרכובות אורגניות אינם מסוגלים לעשות מלחים בעוד תרכובות אנאורגניות לעשות מלחים.
תרכובות אורגניות תמיד מכילות פחמן ואילו תרכובות אנאורגניות מכילות מתכת ואלמנטים אחרים.
• קשרי מימן פחמן הם המאפיין של תרכובות אורגניות בעוד אלה אינם נמצאים תרכובות אנאורגניות.
• תרכובות אנאורגניות מכילות אטומי מתכת כאשר הן אינן נמצאות בתרכובות אורגניות.
• תרכובות אנאורגניות הן מינרלים ואילו תרכובות אורגניות הן ביולוגיות בטבע.
• תרכובות אורגניות הן קוולנטיות ואילו תרכובות אנאורגניות הן קוולנטיות, כמו גם יוניות בטבע.
יש שרשראות ארוכות ומורכבות של מולקולות בתרכובות אורגניות, בעוד שזו אינה תכונה של תרכובות אנאורגניות.
תרכובות אורגניות יכולות להיות מקור אנרגיה לדברים חיים ואילו תרכובות אנאורגניות הן זרזים.