ההבדל בין CDNA ו הגנום הספריה | cDNA לעומת ספריית DNA גנומית

ההבדל העיקרי - cDNA לעומת ספריית הגנום

ישנם שני סוגים עיקריים של ספריות DNA שנבנו על ידי מדענים באמצעות טכניקות הנדסה גנטית. אלה הם ספריית cDNA וספריה הגנום. ההבדל המפתח בין cDNA לבין ספריית הגנום היא כי cDNA הספריה מכילה את הדנ"א המשלים המשוכפל של mRNA הכולל של האורגניזם בעוד ספריית הדנ"א הגנומי מכיל את שברי משובטים של הגנום כולו של האורגניזם. ספריית הדנ"א הגנומית גדולה מספריית ה- cDNA.

-> ->

תוכן

1. סקירה והפרש מפתח

2. מהי ספריית cDNA

3. מהי ספריית הגנום

4. השוואה לצד - cDNA לעומת ספריית הגנום

5. סיכום

מהי ספריה גנומית?

ספריית דנ"א גנומית היא אוסף של שיבוטים הנושאים את שברי הדנ"א הגנומי הכולל של אורגניזם. הוא מכיל את כל הדנ"א הגנומי של האורגניזם הזה, כולל קידוד ו sequencing noncoding. בניית ספריה גנומית מבוצעת על ידי טכנולוגיית ה- DNA רקומביננטי ואחריו שיבוט (הנדסה גנטית). ישנם שלבים שונים המעורבים בבנייה כפי שמוצג בתרשים 01. התהליך מתחיל בבידוד הדנ"א הגנומי. באמצעות פרוטוקול מתאים DNA החילוץ, הדנ"א הגנומי הכולל של האורגניזם צריך להיות מבודד. ואז ה- DNA צריך להיות מומר לגדלים לניהול או לשברים ספציפיים על ידי הגבלת endonucleases (DNA חיתוך אנזימים). ה- DNA המצולק צריך להיות מוחדר לתוך וקטורים באמצעות ליגאזי DNA (DNA המצטרף אנזימים). וקטור הוא אורגניזם משכפל את עצמו. פלסמידים ו bacteriophages משמשים בדרך כלל וקטורים בטכנולוגיה DNA רקומביננטי. אלה וקטורים ligated ידועים כמו מולקולות דנ"א רקומביננטי מאז הם נושאים הן רצפים דנ"א עצמו והכניסו. רקומביננטי וקטורים מתווספים חיידק המארח ועשה כדי לקלוט את וקטורים רקומביננטי בתוך התא חיידקי. חיידקים עם וקטורים רקומביננטי (פלסמידים) צריך להיות גדל במדיום התרבות. במהלך הכפל החיידקי, DNA חיידקי, יחד עם פלסמידים רקומביננטי, לשכפל הגנום שלהם מייצר שיבוטים. שיבוטים אלה מכילים את כל הגנום של האורגניזם המקורי. לפיכך, הוא נקרא ספריה גנומית. פלסמידים יכולים בקלות להיות מופרדים מן הדנ"א הכרומוזומלי חיידקי לבנות את הספריה הגנומית של האורגניזם. אם אורגניזם מסוים מכיל גנים מעוניינים, קל לזהות אותו בספריה הגנומית על ידי הכלאה באמצעות בדיקות מולקולריות (סמנים).

ספריות גנומיות חשובות לחקר המבנה הגנטי ותפקודו, גנים ספציפיים, מיקום גנים, מיפוי גנים, מוטציות, רצף גנים, זיהוי גנים טיפוליים חדשים ועוד.

איור 3: בניית א ספריה גנומית

-> ->

מהי ספריית cDNA?

ספריית cDNA הוא אוסף של דנ"א משלים (cDNA) שיבוטים מסונתז מ mRNA סך של אורגניזם. הליך הבנייה כולל שלבים שונים. טיהור של mRNA הכולל מן האורגניזם הוא הצעד הראשון המעורבים. MRNA מבודדים מומרים cDNA גדילים על ידי תהליך שנקרא שעתוק לאחור. שעתוק הפוך הוא הקל על ידי אנזים שנקרא transcriptase הפוכה. הוא משתמש קטן 3 'פריימר ויוזמת את הסינתזה של cDNA הראשון strand משלימה תבנית mRNA גדיל. כתוצאה cDNA תקועים כפול להמרה לשברים קטנים יותר באמצעות הגבלת endonucleases ומוכנס לתוך וקטורים מתאימים. אלה מולקולות recombinant נבנה מכן לתוך אורגניזם המארח גדל במדיום תרבות לייצר שיבוטים. אוסף של שיבוטים המכילים שברי cDNA של האורגניזם ידוע כמו ספריית cDNA. פרוסה מלאה mRNA בוגר אינו מכיל אינטרונים ואזורי הרגולציה. לכן לא קידוד שברי אינם נוכחים בספריות cDNA שלא כמו בספריה הגנומית.

ספריות cDNA הם חשובים לניתוח של אזורי קידוד, פונקציות הגן, ביטוי של גנים וכו '

Figure_2: בניית ספריית cDNA

מה ההבדל בין cDNA לבין ספריית הגנום?

- diff מאמר בינוני לפני טבלה ->

cDNA לעומת ספריית הגנום

cDNA הספרייה היא אוסף של שיבוטים הנושאים את ה- DNA המשלימה ל mRNA של האורגניזם
הספריה הגנומית היא אוסף של שיבוטים הנושאת את סך הדנ"א הגנומי של האורגניזם.	קידוד לעומת רצפים ללא קידוד
ספריית cDNA מכיל רק את רצפי קידוד; הוא אינו מכיל אינטרונים.
הספריה הגנומית מורכבת מכל הדנ"א הגנומי הכולל דנ"א (nonroding) ו- DNA.	גודל
הספרייה cDNA הוא קטן.
הספריה הגנומית גדולה.	החל חומר
חומר המוצא הוא mRNA
חומר המוצא הוא DNA.	מעורבות תעתיק הפוך.
שעתוק לאחור קורה סינתזה cDNA הראשון גדיל.
שעתוק הפוך לא קורה.	תקציר - cDNA וגנום הספריה

הספריה הגנומית מייצג אוכלוסייה של שיבוטים הנושאים את הדנ"א הגנומי הכולל מקוטעת של אורגניזם. ספריית cDNA מייצג את האוכלוסייה של שיבוטים הנושאים DNA משלימה של mRNA סך של אורגניזם. שיבוט cDNA מכיל רק את הרצפים שנמצאו mRNA בעוד שיבוט הגנומי מכיל רצפים של הגנום כולו. זהו ההבדל בין cDNA לבין הספריה הגנומית.

הפניה:

1. חנאף, דינה קוצ'וני ג'אזיר. "ההבדל בין ספריית הגנום ו cDNA. "ההבדל בין ספריית הגנום ו cDNA. נ., n. ד. אינטרנט. 15 בפברואר2017

2. שטקל, דב י ', יואב גית ופרנצ'סקו פאלצ'יאני. "השוואה של ביטוי גנים מספריות cDNA מרובים. "מחקר הגנום. הקרה ספרינג הרבור מעבדה הקש, דצמבר 2000. אינטרנט. 16 פברואר 2017

3. "ספריית הגנום ספריות עבור גנים המעורבים N- בוטאנול סובלנות ב Escherichia coli. "ספריית הגנום ספריות עבור גנים המעורבים N- בוטאנול סובלנות ב Escherichia coli. נ., n. ד. אינטרנט. 16 פברואר 2017

Image באדיבות:

1. "גיבוש ספריית cDNA" על ידי PhD Dre בשפה האנגלית Wikipedia (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia

2. "גנום ספריה בניה" על ידי Aluquette - עבודה עצמאית (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia