ההבדל בין SiRNA ו- shRNA | shRNA לעומת siRNA
shRNA לעומת siRNA
במהלך תהליך של הפרעות RNA (RNAi), הביטוי של גן המטרה הוא דפק למטה עם סגוליות גבוהה וסלקטיביות. RNAi הוא תהליך טבעי, והוא כרוך קטן מפריע RNA (siRNA) ו RNA קצר מכבנה (shRNA) ו shRNA דו תפקודי. כיום, RNAi נעשה שימוש נרחב ככלי לטיפול בסרטן אישית. היישומים של RNAi נעשים בעיקרון עם siRNA כפול סינתזה chemred ו ווקטורית מולקולות shRNA מבוססות. למרות שלשתי המולקולות הללו יש תוצאות תפקודיות דומות, הן שונות במבנה שלהן; לפיכך, המנגנונים המולקולריים של הפעולה, מסלולי ה- RNA, והשפעות מחוץ-היעד של שתי המולקולות הללו שונות זו מזו.
-> ->shRNA
shRNA הוא רצף של מולקולה קטנה RNA אשר עושה סיבוב סיבוב חזק שניתן להשתמש בהם כדי להשתיק ביטוי גנים היעד במהלך RNAi. ביטוי של shRNA מושגת על ידי וקטור, אשר יכול להיות גם וירוס או חיידק או על ידי משלוח של פלסמידים. הם מסונתזים בגרעין התאים ומועברים לציטופלסמה לתהליכים נוספים. מולקולות אלה יש מסלולים התבגרות דומה של מירנה; ובכך סינתזה של מירנה סיפק את הקרקע להבנה של סינתזה shRNA. או RNA פולימראז II או III יכול לתמלל shRNA דרך RNA פולימראז II או III האמנים. היתרון של השימוש של shRNAs היא כי יש להם שיעור נמוך יחסית של השפלה ותחלופה. החיסרון הוא שהוא צריך וקטור ביטוי, אשר עלול לגרום כמה בעיות בטיחות.
->>>siRNA
siRNAs הם מולקולות רנ"א תקועות כפולה המורכבות מ -25 זוגות זוג באורך. אלה משמשים לדיכוי גנים על ידי השתקת כל גן עם רצף נוקליאוטידים משלימים במסלול RNAi. ג'ין מציאה על ידי transfection של siRNA הוא לעתים קרובות נכשל בשל אפקט חולף; במיוחד בתאים מחלקים במהירות את הדיכוי לא מחזיק מעמד זמן רב יותר. כדי להתגבר על בעיה זו, siRNA משתנה על ידי החדרת מבנה סיכת ראש קצר. זה שונה מולקולה מכן נקרא shRNA. shRNA יש להמיר ל siRNA על ידי דיסר על מנת להמשיך בתפקוד הרגיל שלה.
-> ->מה ההבדל בין shRNA ו siRNA?
בניגוד ל- siRNA, ל- shRNA יש מבנה סיכות נוסף. shRNA הוא גרסה שונה של siRNA.
• shRNA דורש וקטור ביטוי, בעוד siRNA לא.
• shRNA ניתן להשתמש עבור מציאה לטווח ארוך בעוד siRNA ניתן להשתמש רק עבור מציאה לטווח קצר של הגנים.
בניגוד לדיכוי הגן של siRNA, דיכוי ה- shRNA נמשך זמן רב, ואם הוא מוכנס דרך וקטור ויראלי מתאים, הוא עלול לייצר תופעות של השתקת גנים קבועים.
• Dicer נדרש להמיר את ה- shRNA בחזרה למולקולת siRNA על מנת לבצע את הפונקציות הרגילות שלו.
